Cherchant à établir une dynastie héréditaire au XVIIe siècle, les beys mouradites tentèrent de gagner le soutien de l’establishment malékite de Tunis, Mourad II, fils de Hammouda Pacha El-Mouradi, fonda cette medersa en 1673, au souk des Etoffes, tout près de la Grande Mosquée à l’emplacement d’une caserne détruite. Aujourd’hui ce bâtiment, à l’instar de plusieurs autres medersas, a renoué avec son rôle de lieu d’enseignement ; il est utilisé comme centre de formation dans les métiers de l’artisanat.